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Bienvenue

Bienvenue sur le portail d'ontologies francophone développé par le LIRMM en partenariat avec le National Center for Biomedical Ontology’s. BioPortal est une application web permettant de partager et de d'exploiter (navigation, annotation, recherche de concepts) des ontologies biomédicales françaises.

Pour commencer

BioPortal permet à ses utilisateurs d'exploiter des ontologies mises en ligne : explorer, télécharger, commenter, rechercher des concepts, créer des mappings.

Explorer les ontologies

Les utilisateurs peuvent explorer des ontologies sous forme d'arborescence, accéder à leur méta-données et les télécharger.

Documentation

Examples et documentation de l'API REST : documentation BioPortal.

Contact

Pour recevoir des notifications à propos de nouvelles releases de BioPortal, envoyez un courriel à notifications@bioportal.lirmm.fr

Citer le BioPortal français

Clement Jonquet, Amina Annane, Khedidja Bouarech, Vincent Emonet & Soumia Melzi. SIFR BioPortal : Un portail ouvert et générique d’ontologies et de terminologies biomédicales françaises au service de l’annotation sémantique, In 16th Journées Francophones d'Informatique Médicale, JFIM'16. Genève, Suisse, July 2016. pp. 16.

Citer le BioPortal du NCBO

Noy, N.F., Shah, N.H., Whetzel, P.L., Dai, B., Dorf, M., Griffith, N., Jonquet, C., Rubin, D.L., Storey, M.A., Chute, C.G., Musen, M.A. BioPortal: ontologies and integrated data resources at the click of a mouse. Nucleic Acids Res. 2009 Jul 1;37(Web Server issue):W170-3. PMID: 19483092. doi:10.1093/nar/gkp440